Die Iscariot Organisation, benannt nach Judas Iscariot, der Apostel, der Jesus verraten hat, ist eine streng geheime Abteilung des Vatikan (der Bereich, desen existens bestritten wird), die mit der aktiven Verfolgung und Vernichtung von Dämonen (zB Vampire) und Ketzer beauftragt ist. Angesichts der Tatsache, dass die Hellsing-Organisation nicht nur Vampire beschäftigt, sondern auch auf den Grundsätzen des Protestantismus aufbaut, ist Iscariot ihr natürlicher Konkurrenten, trotz ihrer ähnlichen Zielen.
Die Iscariot "Paladinen" sind die Elite der Bekämpfung der Gewalt Iscariot Organisation. Sie tragen lange Soutanen und Kreuze, in der Art und Weise wie ihrer prominentestes Mitglied, Alexander Anderson. Sie sind bekannt, den Kampf mit einer Vielzahl von Waffen, in der Regel der Situation (z. B. Alexander Anderson gesegnet Bajonette, die besonders wirksam gegen Vampire sind, während Heinkel Wolfe mit einfachen Pistolen bewaffnet ist, die wirksam gegen ihre menschlichen Ziele sind) angemessen. Die Vatican's Special Abteilung XIII kann auch Befehle an andere scheinbar unabhängige Streitkräfte geben, Zum Beispiel die Ritter der weise Brüder, die Ritter des Ordens von Calatrava La Nueva, die Ritter von der Military Order of St. Stefano di Toscana, und die Ritter der Order of Malta.
Zusätzlich zu Iscariot, gibt es einen weiteren besonderen Abschnitt des Vatikans, Abteilung III Matthew, benannt nach St. Matthew. In der dritten Episode Crossfire, wird Abteilung III als "John beauftragt Informationen zu unterdrücken. Außerdem ist ihr Ziel das Auffinden von verschiedenen heiligen Reliquien und Artefakte. Dies steht im Einklang mit den Namen "Matthäus", der sich aus dem aramäischen Namen "Mathai," Bedeutung "Geschenk Gottes"ableitet. Sie waren diejenigen, die den heiligen Nagel der Helena, und gab ihn Iscariot, die es Alexander Anderson liehen für den Einsatz im Kampf gegen den Vampire von Hellsing, Alucard.
Wenn Matthew die Abteilung III und Abteilung XIII Iscariot ist, dann ist es wahrscheinlich sicher dass es elf weitere Abschnitte des Vatikans gibt, jeder von ihnen nach ein Apostel Jesu, und jeder von ihnen mit einem anderen Zweck.
